Организм млекопитающих состоит из более чем 200 типов клеток, почти все они имеют одинаковый геном, но отличаются морфологией и функциями. Эти различия обусловлены специфическим для каждой клетки генным регуляторным механизмом.

Геном млекопитающих имеет сложную организацию регуляторных последовательностей, связанных с различными регуляторными элементами. Линейная ДНК в ядре сворачивается очень сложным образом, и это сворачивание приближает друг к другу удаленные друг от друга участки.

Сочетание различных ДНК-связывающих белков, таких как транскрипционные факторы и гистоны; эпигенетические метки, такие как положение генов и динамическая модификация ДНК и гистонов; трехмерная организация регуляторного ландшафта взаимодействуют повсеместно и специфично для клеток, создавая сложные пространственно-временные паттерны экспрессии. Подходы, основанные на иммунопреципитации хроматина (ChIP seq) и захвате конформации хромосом (Hi C и 5C), могут быть интегрированы с дробным секвенированием всего транскриптома (RNA-Seq) для расшифровки пространственного паттерна связывания регуляторных элементов с их генами-мишенями.

. .