Les différentes techniques d'amplification isotherme sont les essais d'amplification du signal, les essais d'amplification de la sonde et les essais d'amplification de la cible. Les techniques moléculaires utilisées pour la détection de la résistance aux quinolones consistent en l'utilisation de diverses techniques telles que la réaction en chaîne de la polymérase, le polymorphisme de longueur de fragment, la PCR, le polymorphisme de conformation simple brin, l'analyse du séquençage du nucléotide et la réaction en chaîne de la polymérase spécifique à l'allèle multiplex.

Les principales techniques d'analyse des acides nucléiques sont les techniques d'acides nucléiques amplifiés, les puces à ADN et les techniques d'acides non amplifiés. Le test d'amplification assistée par la recombinase (RAA) a été appliqué avec succès à la détection d'agents pathogènes bactériens et viraux et permet de surmonter les difficultés techniques posées par les méthodes d'amplification de l'ADN, car il ne nécessite pas de dénaturation thermique de la matrice et fonctionne à une température basse et constante.

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