I batteri lattici (LAB) sono importanti dal punto di vista economico per la loro attitudine fermentativa e conferiscono anche benefici salutistici e nutrizionali. Pediococcus acidilactici NCDC 252 (NCDC 252) è un potenziale probiotico con un nuovo genoma che ha mostrato tutti gli attributi probiotici in vitro, colonizzazione nell'intestino e sopravvivenza in condizioni che imitano il fluido gastrico, intestinale e vaginale.

Il genoma è stato esaminato per la sua capacità di produrre peptide antimicrobico (AMP). L'AMP dell'NCDC 252 è stato isolato e purificato contro il ceppo indicatore (Escherichia coli).

La produzione di AMP è stata ottimizzata nel brodo MRS a 32 °C, pH6 e fino a 36 ore di incubazione sia in condizioni aerobiche che anaerobiche. L'AMP è stato purificato 2,2 volte con una resa del 7,2% e un'attività specifica di 64,5 U mg/mL utilizzando la precipitazione con solfato di ammonio (fino al 70%) e la cromatografia con filtrazione su gel.

Il peso molecolare dell'AMP purificato è stato calcolato essere 2,5 KDa. Gli studi SDS-PAGE e LC/MS della tricina hanno confermato che si tratta di un peptide a basso peso molecolare.

L'AMP era stabile nell'intervallo di pH compreso tra 3 e 9 e nell'intervallo di temperatura compreso tra 40 °C e 100 °C. Il trattamento enzimatico ha inattivato l'AMP mentre il trattamento detergente ne ha potenziato l'attività.

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